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日志

Patchmaster 中的数据转到MiniAnalysis中去分析的办法

热度 1已有 3355 次阅读2006-4-6 22:44 |个人分类:软件使用|


 首先要把PATCHMASTER2.1的数据成PULSE8.6数据的格式.

 打开MINIANALYSIS软件的ABF UTILITY功能插件,在左边找到刚才转换过的数据文件.选中后点CONVERT FILE TO ABF.

弹出的窗口按是.


 这里就要设置下了,SAMPLING 应该改为978,这是根据多次调试得出的数值,建议也在你的票贩子上根据PATCHMASTER和MINIANALYSIS的SCALE调试.SCALING FACTOR为0.002,默认为0.001,这敢是一样,与你PATCHMASTER的SCALE有关.如果PATCHMASTER的GAIN为2MV/PA,那这里就是0.002,如果GAIN为10MV/PA,那这里为0.01.也需要调试,根据实际情况改,千万不要搞错,否则数据全错了.

 转换后会在窗口出现转换后的文件名称.



在MINIANALYSIS主窗口中打开文件进行下一步分析.


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发表评论 评论 (12 个评论)

回复 idaix 2006-10-25 18:04
sampling intervel 是T scale肯定不是经验值。978相当于1.02KHz。如果是20Hz,就应该是50 micro second.

QUOTE:
以下为blog主人的回复: MINIANALYSIS 对PATCHMASTER的数据支持不是很好。这么做,是没有办法的办法。这样的转换是在MINI软件中经过比较后得出的。要不SCALE会和PATCHMASTER中的不一样。
回复 刘刘 2007-4-15 00:38
我的minianalysis怎么没有功能啊?yw0531@126.com 谢谢指教

QUOTE:
以下为blog主人的回复: 说得也太不清楚了吧,没什么什么功能?你要什么样的功能?
回复 Q 2007-12-6 23:29
哪位大侠能帮忙说一下如何应用minianalysis分析电压啊,不胜感激啊

QUOTE:
以下为thinker的回复: minianalysis网站主页有帮助文件的,去看下就可以了。是英文的。
回复 Q 2007-12-10 03:38
斑竹,我想分析burst,用的是convert unknow binary to ABF(只有这个转换完后的波形是正常的),转换时有个对话框(这个网页上就有),有很多settings,包括sampling interval、Scaling factor等不知该如何设置?转换完后,图上的坐标与实际数据完全不符,如原始数据上的间隔时间为800ms,可是转换完后变成了几千ms,这是不是与之前的转换有关?还有如何分析一个burst中的锋间距,超极化电位?希望thinker大侠能详细指点

QUOTE:
以下为thinker的回复: 要测试不同的SCALE FACTOR。没有太多规律可遁。锋间距容易啊,你测试到PEAK的时间值后,两两相减就得到间距了。
回复 Q 2007-12-10 03:44
见到斑竹的留言小弟万份激动,就象抓住一根救命稻草[emot]2[/emot]不知斑竹是否方便留个邮件

QUOTE:
以下为thinker的回复: shenwh@cshl.edu
回复 godisagirlxx 2007-12-12 05:35
转换数据时经过一番试,终于转出的图形和signal记录的一样了,可是我想分析超极化后电位,应该怎么做啊?

QUOTE:
以下为thinker的回复: 分析超极化后电位什么?
回复 访客xfwawa 2008-2-2 03:45
请问我下载的Mini60exe文件怎么不能使用啊?总是提示要注册,我选择拒绝注册后不能分析文件!请教斑竹!

QUOTE:
以下为thinker的回复: 只是一个提示框而已,你用ESC键取消就行了。不要确定要注册或拒绝注册。
回复 访客sWNa61 2008-3-20 22:36
我将转换好的数据导入MINIANALYSIS后, 可以显示出正确的记录曲线,但我无法选取峰, 不论用鼠标点还是让自动选取都没有反映,请问大概是什么问题?
回复 访客128Kb5 2008-3-21 17:14
那就是MINIANALYSIS的使用问题了,试着把THRESHOLD改小点试下。还有其它的参数值也相应调整下。

QUOTE:
以下引用访客sWNa61(游客)在2008-3-20 15:36:20发表的评论: 我将转换好的数据导入MINIANALYSIS后, 可以显示出正确的记录曲线,但我无法选取峰, 不论用鼠标点还是让自动选取都没有反映,请问大概是什么问题?
回复 访客sWNa61 2008-3-21 17:36
我将转换好的数据导入MINIANALYSIS后, 可以显示出正确的记录曲线,但我无法选取峰, 不论用鼠标点还是让自动选取都没有反映,请问大概是什么问题? 已经尝试调整了各种参数,但依然无法选取峰. 程序自带的SAMPLE数据文件可以被正常选取.是否是转换文件有什么问题?请问谁遇到过这种情况?
回复 访客sWNa61 2008-3-21 20:30
将ASCII文件转换为ABF后,可以正常显示,但无发选取峰.请问诸位有没有遇到过这种情况
回复 访客128Kb5 2008-3-23 18:23
你说的无法选取是指没法测量峰的大小?有没有改下参数?你可以把文件发给我,帮你看下。bioguider@gmail.com

QUOTE:
以下引用访客sWNa61(游客)在2008-3-21 13:30:06发表的评论: 将ASCII文件转换为ABF后,可以正常显示,但无发选取峰.请问诸位有没有遇到过这种情况[br]

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